교수님이 프로젝트 권유하시는데 분야가 마음에 들지 않는 경우

안녕하세요. 박사 입학했는데 교수님이 펀딩 프로젝트에 메인으로 참여하는 것 권유하셨습니다. 발표는 교수님이, 연구는 저랑 교수님이 메인으로 하고 석사 친구가 보조하기로 이야기 하셨는데요.
교수님께 1대1로 배울 기회가 첫 학기에 많아 좋은 기회일 것 같기도합니다.
프로젝트 application이 상하수도 슬러지 처리인데 제가 나중에 원하는 취업 분야와 많이 다릅니다.. 물론 사용하는 기술은 제 관심분야 이구요.
박사 디펜스때 총 3 chapter를 쓰게 되는데 첫 chapter의 application이 제가 원하는 분야와 많이 달라 조금 걱정이 됩니다.
앞으로의 프로젝트 할당이나 연구 주제 정할 때 계속 이 application 위주로 진행이 된다던지 큰 영향이 있을까요?