학연과정 하려는데 고민이 됩니다... 조언 부탁드립니다.

안녕하세요 지거국 졸업한 학생입니다.
저는 현재 한 공공 연구소에서 인턴을 하고있습니다.
박사님께서 엄청 잘해주시고 복지나 급여도 괜찮습니다. 그래서 원래 이 박사님 아래에서 학연과정을 하려고 얘기도 다 마친 상황이었는데 높은 연구원에서 학연과정으로 석사를 모집하는 곳에 지원을 했다가 붙었습니다.
물론 아직 현 연구소에서 학연할 실험실은 정해지지 않았구요, (컨택해야합니다.) 위쪽 연구원으로 가면 메이저급 대학으로 갈 수 있을 것 같습니다. S아래로...
전공은 조금 다르긴 한데 크게 다르지 않고 조건은 매우 좋습니다. 하지만 랩실, 석사, 학연이라는게 분위기나 함께하는 사람들이라는 부분도 무시못하잖아요. 그래서 걱정이 됩니다.
최소 2년이니 어떤 랩실이라도 견디는게 맞다는 생각도 들지만 지금 여기서 하는 것도 괜찮을 것 같고.. 힘듭니다.
정말 간다면 박사님께 어떻게 말씀드릴지도 모르겠습니다. 미래에 대해 정말 얘기 많이했는데 덜컥 가버린다고 하면..
조언 부탁드립니다. ㅠㅠ
참고로 현재 학점이나 토익 등 학부생 기준으로의 스펙은 높은 편입니다.

+ 혹시 위쪽 학연이 되었는데 학교랑 컨택이 안 될 가능성도 있을까요?
저번에 질문하니 학교 컨택이 안되면 학연도 진행못한다고 하더라구요...
전공은 전화기입니다. 이것 저것 좋은 쪽 택하려다가 이도 저도 아닌게 되버릴까봐 겁도 납니다